RNA-seq

• 2024年8月13日

【PyDESeq2の使い方】発現変動遺伝子を解析する

ぴよこ RNAseqのデータを用いて発現量が変動した遺伝子を解析したい まさる博士 それなら、PyDESeq2が便利だよ 本記事では、PyDESeq2を用いて、発現変動遺伝子を解析する方法について解説します。   PyDESeq2とは PyDESeq2の前に、DESeq2について説明します […]

• 2024年8月12日
• 2024年8月13日

【pytximportの使い方】転写産物ごとの発現量データを遺伝子ごとの発現量に変換する

ぴよこ kallistoで解析したデータをその後の解析にどうやって使えばいいのかわからない。調べたらtximportが便利みたいだけど、R使ったことないからできなさそう。。。 まさる博士 そんな君に朗報！tximportのpythonバージョンであるpytximportがあるよ RNAseq解析にお […]